一、醫藥方面
?、俜蛛x分析藥物的組合含量：由于一種藥劑常含有多組分，色譜方法是既能分離又能定量的方法。如脂溶性維生素片，含有鉻維生素，有C18柱及含1%碳酸銨的甲醇為流動相。一次即可將各維生素B6、D1、A、E同時分離并定出含量。又如止痛藥或退燒藥也可用此法分離并測得各組分的含量。
?、谒幬锷a中進行中間控制：生產抗菌素時，首先要了解發酵液中的主體與付產物的存在情況。例如：青霉素、四環素、頭孢子菌素、紅霉素、柔紅霉素、慶大霉素等的發酵產物，均可用C18柱和甲醇及緩沖液配制的流動相或用離子對法，分析主體及其收產物的含量。
③分析藥物在體內的殘量：這是近來研究新藥效能很主要的內容之一，如冬凌草甲素是植物中的一組分，有抗癌效果，但是毒性大。測定其在血清中含量很重要，現在可用C18柱及甲醇水為流動相，測定處理后的血清樣品，即可得到血中的含量。如磺胺類藥品在血清及尿中含量也不允許太大，可用C18柱及酸性乙醇為流動相，測定含量后，則可估計zui合適的用藥劑量。又如四環素、巴比妥酸、止痛藥、退燒藥、護糖尿病的藥物等，在血或尿中的含量都可用C18柱用甲醇、水為流動相來測定含量。因此，反相色譜法應用范圍極廣。
?、軠y定藥物在各種器官中的代謝產物，特別是研究藥物的代謝產物在血清中存在的情況。如測血清中的酮酸及戊二酸。測尿中代謝產物更為方便，不需要繁鎖的預處理。因為研究尿中的組分能鑒別病人的代謝功能，對病理研究或監床診斷均具有重要的參考價值。
二、天然產物組分分析方面
天然物的組分非常復雜，如中草藥中各組分含量多少對藥劑作用影響很大。用此技術分離分析，具有簡便、快速的特點。氨基柱能分離分析天然物中糖的組分。氰基柱能分離中藥紫草及其衍生物的組成。硅膠柱能測定成藥中馬錢了堿、苦堿等含量。C18柱分離丹參中主要組分兒茶酚、桂皮中桂皮酸、煙草中的酚類化合物、麥角或中各種植物堿，這些都是近來日益受到重視的結果。
該行業均有使用到液相（分析成分，含量），氣相（分析成分，含量，農殘）及質譜等儀器的潛力，但不同規模的企業對儀器的需求差別很大。目前國家沒有針對性的標準，主要以國家標準（2010版）為參考。
三、生化方面
主要方向是分析嘌呤、嘧啶基的核甙或核甙酸及具有相應的肽和蛋白質。
①在細胞核中有種類繁多的甙及核甙酸，可用不同的檢測器或酶轉移檢測器或利用酶反應進行定性測定。用離子交換柱和緩沖游泳梯度淋洗。C18柱用含磷酸的緩沖水溶液的梯度淋洗法均能得到滿意的結果。
②分析核酸近年來有關分析核酸的研究很多，主要是分離RNA、DNA及碎片?，F在使用硅烷化的硅藻土或長碳鏈季胺鹽涂漬＝在上面制成系列填充柱。已能分離t-RNA,r-RNA及DNV碎片。有沒的緩沖液淋洗，還可利用此技術做RNA碎片的序列分離制備工具，對生物研究起了重要的作用。
?、郯被?、肽、蛋白質的分析，氨基酸分析主要是制成熒光衍生物或酰氯的衍生物，然后測定其序列。近來也可用液相色譜的柱后衍生物法測定其序列。操作簡便、速度快、深受歡迎。用四烷基氯化胺肽形成離子對或凝膠色譜測定蛋白質，其分離效果也很好。
（補充下：氨基酸用液相檢測，需用柱前衍生法和柱后衍生法來處理樣品，可參照《氨基酸色譜分離方法簡析》）
?、苊傅姆治?，酶是在血清及其他生理樣品中常有的反應產物，化學分析法操作不便，易造成誤差，用色譜技術分析，具有操作簡便、快速、準確的特點。如測定堿性或酸性磷酸酶的含量，測定反應產物中腺甙脫 胺酶的含量等，目前對酶用色譜法分離分析的研究工作已開展很多。
⑤糖的分析，糖的分析是其它方法較難完成的。如把糖與硼酸緩沖液預選混合，使生成糖-硼酸絡合離子，再進行分離?？砂颜崛樘恰⑻J糖、果糖、阿拉伯糖、巖藻糖、半乳糖、山梨糖、木糖、葡萄糖等幾十種，全部分開。也可用胺基柱分離各種天然產物中伯糖的各繃分。
四、食品分析
分析食品或動物飼料中的嘌維生素含量，是當前食品工業中的重要課題。如今此技術已在分析咖啡中的黃嘌泠、調料中的核甙酸及核甙、果汁中的有機酸、米中的維生素、牛奶中的維生素D等都對食品營養價值提供有效數據。
分析食品中的有毒成分，如蘋果中農藥萘乙酸、牛奶中的硝基呋喃腙、食品添加劑石臘油中的苯并芘、魚體中的有機汞等。
五、環境分析
主要針對大氣中污染的成分分析，廢水和汽車尾氣中有害組分的分析。如柴油機排出的顆粒，用有機溶劑溶解后，經色譜分析結果，有多環芳烴的硝基物，這是對人體健康有很大潛在危險的化合物。又如藥廠排出的廢水中有大量硝酚、斯蒂芬酸；染料廠排出廢水中的苯胺等。用液相色譜分析簡便迅速。
六、農業分析
農業中需要對各種作物中的營養成分進行各種含量分析。而液相色譜對多糖、脂肪酸蛋白質等分析都是極為有效的方法，因此應用頗為廣泛。
七、高分子材料的分析
高分子工業材料及生物高分子分析是近年來新興的課題。凝膠色譜是分離分析高分子組成及鑒定其性能的方法。高分子材料中填充各種助劑、乳化劑、分散劑等物的分離，色譜技術也*特點。
①控制高分子產品質量 在生產工藝中，可利用凝膠色譜測定聚合物小分子雜質。如用凝膠色譜測定環氧樹脂中未聚合的雙酚A，用C18柱分離小分子環氧化合物，小分子聚苯乙烯或不能成膜的聚脂等，用以鑒定聚合物的質量。
?、跍y定聚合物的分子量分布寬度 分子量大小和分子量分布寬度是衡量聚合物質量的一種重要指標，用凝膠色譜可以測定。
?、鄹邷啬z色譜測聚合物的老化、降解現象及分級。如測定聚乙烯分子量應為四萬左右，通過分析可將分子量1000以下的聚乙烯蠟分開。還可用來觀察高密度聚乙烯的氧化過程，觀察聚苯乙烯、環氧樹脂、聚磺酸脂、尼龍及聚醚聚砜等的降解情況。
?、軠y定高分子材料的適用性 日常食品的高分子材料包裝的很多，如果測定食品中有高分子材料，則說明這種高分子材料不適于做食品和包裝。
八、無機分析
自從有了離子交換柱后，液相色譜又有一個新分支——離子色譜。它能分析有機離子化合物，也能分析無機離子。特別是用在一般方法難以分離的陰離子，稀土元素，稀有元素等的分離方面。還可以制成金屬絡合物的結構進行分離，較用萃取比色法測含量方便得多。是一種很有前途的分析方法。
九、化工方面
①利用分析結果找*工藝條件 如抗氧劑對叔丁基酚，為烯烴與鄰苯二酚反應而得，通過反復在工藝過程中對生成各組分的含量分析，可求得*反應溫度及原料配比?？赏ㄟ^硅膠柱分析主體中所出現的雜質求得催化劑的品種及其適當的濃度。
?、诒砻婊钚詣┑姆治觥”砻婊钚允枪I產品中常用的一種原料，其純度與結構應用性能有密切關系，液相色譜的分離有*的效果。如C18柱及甲醇、水為流動相測定非離子表面活性劑時，可得到其純度、分子量大小及添加劑巰基苯并噻唑，也可分離聚乙二醇及吐溫系列物等。
③染料及其中間體的分析 染料中異構物很多，大大影響了染料的色澤。通過分析，了解情況即可在工藝中采取有效措施。如磺酸類染料中間體，可用C18柱及含鹽甲醇為流動相分析。蒽醌類中間體用C18柱及甲醇、水系為流動相。苯胺系列用硅膠柱及含醇環已烷來分離等方法，都很有效。
?、苡袡C酸含量分析 沼氣發酵液、果汁、紅茶菌、油廠廢液等均含有各種有機酸，可用離子交換柱及緩沖液為流動相，都能得到好的分離效果。
?、菥酆衔飭误w的質量分析 如雙酚A是環氧樹脂、聚砜、聚碳酸脂的原料，其質量的好壞與聚合物質量有密切關系，其中以所含異丙烯基苯酚的含量影響zui壞，可須知硅膠柱及氯仿流動相分析其含量，然后在工藝中除去。各種醛、酮的二硝基苯腙衍生物，各種烷基酚，羥苛酷酚等均可用此法分離。
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